Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PUDPQ08623 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PUDPQ08623 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PUDPQ08623 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PUDPQ08623 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PUDPQ08623 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PUDPQ08623 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PUDPQ08623 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PUDPQ08623 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PUDPQ08623 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PUDPQ08623 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PUDPQ08623 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PUDPQ08623 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PUDPQ08623 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PUDPQ08623 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PUDPQ08623 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms