Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms