Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms