Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms