Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms