Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN12Q05209 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms