Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms