Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms