Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms