Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms