Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms