Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX1P83916 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX1P83916 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX1P83916 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX1P83916 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX1P83916 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX1P83916 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX1P83916 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX1P83916 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX1P83916 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX1P83916 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX1P83916 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX1P83916 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX1P83916 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX1P83916 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX1P83916 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX1P83916 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX1P83916 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX1P83916 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX1P83916 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX1P83916 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX1P83916 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX1P83916 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX1P83916 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX1P83916 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX1P83916 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX1P83916 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX1P83916 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX1P83916 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX1P83916 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX1P83916 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX1P83916 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX1P83916 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX1P83916 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX1P83916 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX1P83916 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX1P83916 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX1P83916 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX1P83916 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX1P83916 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX1P83916 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX1P83916 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX1P83916 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX1P83916 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX1P83916 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX1P83916 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX1P83916 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX1P83916 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX1P83916 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX1P83916 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX1P83916 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX1P83916 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX1P83916 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX1P83916 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX1P83916 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX1P83916 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX1P83916 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX1P83916 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX1P83916 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX1P83916 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX1P83916 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX1P83916 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX1P83916 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX1P83916 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX1P83916 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX1P83916 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX1P83916 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX1P83916 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX1P83916 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX1P83916 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX1P83916 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX1P83916 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX1P83916 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX1P83916 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX1P83916 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX1P83916 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX1P83916 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX1P83916 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX1P83916 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX1P83916 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX1P83916 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX1P83916 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX1P83916 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX1P83916 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX1P83916 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX1P83916 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX1P83916 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX1P83916 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX1P83916 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX1P83916 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX1P83916 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX1P83916 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX1P83916 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX1P83916 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX1P83916 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX1P83916 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX1P83916 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX1P83916 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX1P83916 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX1P83916 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms