Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMF1P82094 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMF1P82094 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMF1P82094 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMF1P82094 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMF1P82094 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMF1P82094 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMF1P82094 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMF1P82094 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMF1P82094 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TMF1P82094 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TMF1P82094 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMF1P82094 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMF1P82094 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMF1P82094 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TMF1P82094 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMF1P82094 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TMF1P82094 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMF1P82094 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMF1P82094 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMF1P82094 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMF1P82094 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMF1P82094 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TMF1P82094 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TMF1P82094 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMF1P82094 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMF1P82094 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMF1P82094 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMF1P82094 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMF1P82094 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMF1P82094 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMF1P82094 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMF1P82094 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMF1P82094 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMF1P82094 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMF1P82094 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMF1P82094 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMF1P82094 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMF1P82094 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMF1P82094 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMF1P82094 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMF1P82094 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TMF1P82094 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMF1P82094 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMF1P82094 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMF1P82094 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMF1P82094 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMF1P82094 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMF1P82094 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMF1P82094 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMF1P82094 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMF1P82094 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMF1P82094 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMF1P82094 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMF1P82094 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMF1P82094 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMF1P82094 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMF1P82094 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMF1P82094 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMF1P82094 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMF1P82094 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMF1P82094 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMF1P82094 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TMF1P82094 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMF1P82094 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMF1P82094 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TMF1P82094 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMF1P82094 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMF1P82094 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMF1P82094 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMF1P82094 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMF1P82094 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMF1P82094 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMF1P82094 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMF1P82094 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMF1P82094 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMF1P82094 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMF1P82094 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMF1P82094 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMF1P82094 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMF1P82094 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMF1P82094 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMF1P82094 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMF1P82094 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMF1P82094 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMF1P82094 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMF1P82094 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TMF1P82094 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMF1P82094 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMF1P82094 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMF1P82094 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMF1P82094 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMF1P82094 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMF1P82094 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMF1P82094 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMF1P82094 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMF1P82094 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMF1P82094 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMF1P82094 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMF1P82094 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms