Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX6P78412 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX6P78412 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX6P78412 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX6P78412 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX6P78412 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX6P78412 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX6P78412 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX6P78412 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX6P78412 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX6P78412 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX6P78412 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX6P78412 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX6P78412 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX6P78412 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX6P78412 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX6P78412 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX6P78412 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX6P78412 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX6P78412 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX6P78412 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX6P78412 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX6P78412 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX6P78412 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX6P78412 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX6P78412 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX6P78412 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX6P78412 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX6P78412 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX6P78412 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX6P78412 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX6P78412 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX6P78412 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX6P78412 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX6P78412 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX6P78412 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX6P78412 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX6P78412 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX6P78412 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX6P78412 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX6P78412 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX6P78412 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX6P78412 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX6P78412 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX6P78412 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX6P78412 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX6P78412 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX6P78412 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX6P78412 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX6P78412 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX6P78412 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX6P78412 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX6P78412 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX6P78412 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX6P78412 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX6P78412 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX6P78412 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX6P78412 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX6P78412 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX6P78412 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX6P78412 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX6P78412 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX6P78412 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX6P78412 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX6P78412 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX6P78412 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX6P78412 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX6P78412 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX6P78412 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX6P78412 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX6P78412 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX6P78412 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX6P78412 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX6P78412 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX6P78412 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX6P78412 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX6P78412 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX6P78412 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX6P78412 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX6P78412 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX6P78412 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX6P78412 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX6P78412 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX6P78412 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX6P78412 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX6P78412 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX6P78412 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX6P78412 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX6P78412 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX6P78412 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX6P78412 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX6P78412 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX6P78412 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX6P78412 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX6P78412 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX6P78412 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX6P78412 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX6P78412 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX6P78412 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX6P78412 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms