Protein–RNA interactions for Protein: P63128

ERVK-9, Endogenous retrovirus group K member 9 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-9P63128 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-9P63128 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERVK-9P63128 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ERVK-9P63128 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
ERVK-9P63128 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERVK-9P63128 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ERVK-9P63128 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ERVK-9P63128 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-9P63128 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms