Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB1P62873 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB1P62873 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB1P62873 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB1P62873 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB1P62873 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB1P62873 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB1P62873 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB1P62873 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB1P62873 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB1P62873 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB1P62873 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB1P62873 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB1P62873 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB1P62873 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB1P62873 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB1P62873 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB1P62873 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB1P62873 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB1P62873 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB1P62873 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB1P62873 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB1P62873 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB1P62873 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB1P62873 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB1P62873 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB1P62873 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB1P62873 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB1P62873 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB1P62873 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB1P62873 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB1P62873 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB1P62873 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB1P62873 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB1P62873 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB1P62873 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB1P62873 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB1P62873 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB1P62873 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB1P62873 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB1P62873 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB1P62873 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB1P62873 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB1P62873 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB1P62873 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB1P62873 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB1P62873 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB1P62873 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB1P62873 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB1P62873 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB1P62873 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB1P62873 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB1P62873 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB1P62873 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB1P62873 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB1P62873 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB1P62873 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB1P62873 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB1P62873 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB1P62873 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms