Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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