Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB25P57735 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB25P57735 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB25P57735 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB25P57735 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB25P57735 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB25P57735 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB25P57735 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB25P57735 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB25P57735 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB25P57735 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB25P57735 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB25P57735 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB25P57735 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB25P57735 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB25P57735 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB25P57735 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB25P57735 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB25P57735 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB25P57735 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB25P57735 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB25P57735 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB25P57735 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB25P57735 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB25P57735 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB25P57735 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB25P57735 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB25P57735 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB25P57735 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB25P57735 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB25P57735 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB25P57735 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB25P57735 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB25P57735 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB25P57735 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB25P57735 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB25P57735 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB25P57735 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB25P57735 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB25P57735 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB25P57735 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB25P57735 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB25P57735 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB25P57735 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB25P57735 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB25P57735 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB25P57735 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB25P57735 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB25P57735 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB25P57735 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB25P57735 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB25P57735 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB25P57735 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB25P57735 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB25P57735 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms