Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2BFSP57053 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms