Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms