Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MVDP53602 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MVDP53602 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MVDP53602 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MVDP53602 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MVDP53602 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MVDP53602 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MVDP53602 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MVDP53602 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MVDP53602 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MVDP53602 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MVDP53602 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MVDP53602 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MVDP53602 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MVDP53602 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MVDP53602 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MVDP53602 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MVDP53602 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MVDP53602 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MVDP53602 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MVDP53602 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MVDP53602 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MVDP53602 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MVDP53602 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MVDP53602 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MVDP53602 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MVDP53602 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MVDP53602 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MVDP53602 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MVDP53602 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MVDP53602 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MVDP53602 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MVDP53602 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MVDP53602 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MVDP53602 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MVDP53602 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MVDP53602 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MVDP53602 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MVDP53602 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MVDP53602 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MVDP53602 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MVDP53602 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MVDP53602 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MVDP53602 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MVDP53602 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MVDP53602 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MVDP53602 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MVDP53602 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MVDP53602 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MVDP53602 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MVDP53602 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MVDP53602 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MVDP53602 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MVDP53602 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MVDP53602 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MVDP53602 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MVDP53602 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MVDP53602 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MVDP53602 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MVDP53602 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MVDP53602 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MVDP53602 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MVDP53602 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MVDP53602 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MVDP53602 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MVDP53602 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MVDP53602 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MVDP53602 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MVDP53602 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MVDP53602 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MVDP53602 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MVDP53602 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MVDP53602 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MVDP53602 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MVDP53602 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MVDP53602 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MVDP53602 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MVDP53602 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MVDP53602 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MVDP53602 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MVDP53602 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MVDP53602 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MVDP53602 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MVDP53602 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MVDP53602 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MVDP53602 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MVDP53602 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MVDP53602 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MVDP53602 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MVDP53602 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MVDP53602 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MVDP53602 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MVDP53602 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MVDP53602 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MVDP53602 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MVDP53602 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MVDP53602 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MVDP53602 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MVDP53602 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MVDP53602 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms