Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCR5P51681 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCR5P51681 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCR5P51681 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCR5P51681 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCR5P51681 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCR5P51681 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCR5P51681 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCR5P51681 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCR5P51681 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCR5P51681 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCR5P51681 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCR5P51681 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCR5P51681 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCR5P51681 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCR5P51681 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCR5P51681 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCR5P51681 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCR5P51681 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCR5P51681 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCR5P51681 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCR5P51681 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCR5P51681 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCR5P51681 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCR5P51681 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCR5P51681 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCR5P51681 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCR5P51681 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCR5P51681 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCR5P51681 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCR5P51681 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCR5P51681 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCR5P51681 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCR5P51681 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCR5P51681 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCR5P51681 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCR5P51681 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCR5P51681 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCR5P51681 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCR5P51681 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCR5P51681 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCR5P51681 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCR5P51681 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCR5P51681 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR5P51681 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR5P51681 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR5P51681 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR5P51681 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR5P51681 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR5P51681 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR5P51681 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR5P51681 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR5P51681 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR5P51681 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR5P51681 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR5P51681 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR5P51681 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR5P51681 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR5P51681 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR5P51681 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR5P51681 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR5P51681 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR5P51681 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR5P51681 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR5P51681 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR5P51681 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR5P51681 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR5P51681 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR5P51681 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR5P51681 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR5P51681 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR5P51681 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR5P51681 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR5P51681 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR5P51681 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR5P51681 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR5P51681 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR5P51681 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR5P51681 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR5P51681 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR5P51681 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR5P51681 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR5P51681 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR5P51681 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR5P51681 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR5P51681 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR5P51681 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR5P51681 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR5P51681 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR5P51681 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR5P51681 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR5P51681 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR5P51681 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR5P51681 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR5P51681 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR5P51681 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR5P51681 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR5P51681 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR5P51681 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR5P51681 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms