Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCR4P51679 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCR4P51679 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCR4P51679 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCR4P51679 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCR4P51679 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCR4P51679 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCR4P51679 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCR4P51679 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCR4P51679 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCR4P51679 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCR4P51679 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCR4P51679 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCR4P51679 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCR4P51679 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCR4P51679 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCR4P51679 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCR4P51679 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCR4P51679 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CCR4P51679 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCR4P51679 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCR4P51679 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCR4P51679 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCR4P51679 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCR4P51679 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCR4P51679 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCR4P51679 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCR4P51679 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCR4P51679 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCR4P51679 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCR4P51679 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCR4P51679 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCR4P51679 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCR4P51679 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCR4P51679 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCR4P51679 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCR4P51679 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCR4P51679 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCR4P51679 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCR4P51679 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCR4P51679 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCR4P51679 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCR4P51679 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCR4P51679 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCR4P51679 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCR4P51679 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCR4P51679 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCR4P51679 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCR4P51679 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCR4P51679 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCR4P51679 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCR4P51679 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCR4P51679 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCR4P51679 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCR4P51679 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCR4P51679 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCR4P51679 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCR4P51679 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCR4P51679 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCR4P51679 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCR4P51679 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCR4P51679 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCR4P51679 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCR4P51679 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCR4P51679 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCR4P51679 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCR4P51679 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCR4P51679 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCR4P51679 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCR4P51679 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCR4P51679 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCR4P51679 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCR4P51679 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCR4P51679 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCR4P51679 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCR4P51679 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCR4P51679 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCR4P51679 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCR4P51679 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCR4P51679 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCR4P51679 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCR4P51679 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCR4P51679 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCR4P51679 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCR4P51679 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCR4P51679 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCR4P51679 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCR4P51679 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCR4P51679 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCR4P51679 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCR4P51679 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCR4P51679 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCR4P51679 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCR4P51679 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCR4P51679 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCR4P51679 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCR4P51679 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCR4P51679 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCR4P51679 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCR4P51679 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms