Protein–RNA interactions for Protein: P50553

ASCL1, Achaete-scute homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL1P50553 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL1P50553 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ASCL1P50553 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ASCL1P50553 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ASCL1P50553 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ASCL1P50553 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ASCL1P50553 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ASCL1P50553 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ASCL1P50553 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ASCL1P50553 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ASCL1P50553 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ASCL1P50553 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ASCL1P50553 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ASCL1P50553 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASCL1P50553 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASCL1P50553 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASCL1P50553 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASCL1P50553 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms