Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGS4P49798 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGS4P49798 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGS4P49798 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGS4P49798 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGS4P49798 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGS4P49798 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGS4P49798 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGS4P49798 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGS4P49798 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGS4P49798 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGS4P49798 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGS4P49798 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGS4P49798 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGS4P49798 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGS4P49798 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGS4P49798 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RGS4P49798 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGS4P49798 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGS4P49798 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGS4P49798 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGS4P49798 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGS4P49798 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGS4P49798 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RGS4P49798 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGS4P49798 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGS4P49798 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGS4P49798 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGS4P49798 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGS4P49798 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGS4P49798 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGS4P49798 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGS4P49798 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGS4P49798 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGS4P49798 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGS4P49798 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGS4P49798 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RGS4P49798 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RGS4P49798 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGS4P49798 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGS4P49798 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGS4P49798 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGS4P49798 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGS4P49798 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RGS4P49798 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGS4P49798 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGS4P49798 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGS4P49798 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGS4P49798 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGS4P49798 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGS4P49798 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGS4P49798 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGS4P49798 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGS4P49798 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGS4P49798 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGS4P49798 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGS4P49798 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGS4P49798 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGS4P49798 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGS4P49798 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGS4P49798 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RGS4P49798 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGS4P49798 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGS4P49798 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGS4P49798 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGS4P49798 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGS4P49798 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGS4P49798 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGS4P49798 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGS4P49798 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGS4P49798 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGS4P49798 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGS4P49798 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RGS4P49798 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGS4P49798 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RGS4P49798 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGS4P49798 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGS4P49798 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGS4P49798 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGS4P49798 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGS4P49798 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGS4P49798 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGS4P49798 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGS4P49798 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGS4P49798 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RGS4P49798 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RGS4P49798 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RGS4P49798 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RGS4P49798 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RGS4P49798 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RGS4P49798 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RGS4P49798 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RGS4P49798 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RGS4P49798 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RGS4P49798 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RGS4P49798 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RGS4P49798 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RGS4P49798 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RGS4P49798 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RGS4P49798 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms