Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTPAP49638 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTPAP49638 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TTPAP49638 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTPAP49638 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TTPAP49638 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTPAP49638 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTPAP49638 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTPAP49638 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTPAP49638 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TTPAP49638 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTPAP49638 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTPAP49638 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTPAP49638 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTPAP49638 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTPAP49638 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTPAP49638 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTPAP49638 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTPAP49638 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTPAP49638 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTPAP49638 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTPAP49638 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTPAP49638 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTPAP49638 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTPAP49638 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TTPAP49638 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTPAP49638 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTPAP49638 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTPAP49638 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTPAP49638 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTPAP49638 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTPAP49638 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTPAP49638 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTPAP49638 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTPAP49638 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTPAP49638 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTPAP49638 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTPAP49638 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TTPAP49638 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTPAP49638 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTPAP49638 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTPAP49638 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTPAP49638 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTPAP49638 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTPAP49638 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTPAP49638 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTPAP49638 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTPAP49638 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTPAP49638 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TTPAP49638 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTPAP49638 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTPAP49638 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTPAP49638 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTPAP49638 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTPAP49638 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTPAP49638 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTPAP49638 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTPAP49638 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTPAP49638 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTPAP49638 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTPAP49638 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTPAP49638 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTPAP49638 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTPAP49638 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTPAP49638 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TTPAP49638 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTPAP49638 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTPAP49638 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTPAP49638 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTPAP49638 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTPAP49638 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTPAP49638 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TTPAP49638 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTPAP49638 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTPAP49638 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTPAP49638 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTPAP49638 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTPAP49638 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTPAP49638 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTPAP49638 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTPAP49638 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTPAP49638 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTPAP49638 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TTPAP49638 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTPAP49638 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TTPAP49638 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTPAP49638 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTPAP49638 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTPAP49638 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTPAP49638 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTPAP49638 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTPAP49638 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TTPAP49638 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTPAP49638 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTPAP49638 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTPAP49638 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTPAP49638 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTPAP49638 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTPAP49638 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTPAP49638 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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