Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA4P43694 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA4P43694 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA4P43694 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA4P43694 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA4P43694 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA4P43694 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA4P43694 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA4P43694 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA4P43694 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA4P43694 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA4P43694 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA4P43694 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA4P43694 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA4P43694 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA4P43694 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA4P43694 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA4P43694 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA4P43694 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA4P43694 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA4P43694 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA4P43694 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA4P43694 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA4P43694 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA4P43694 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA4P43694 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA4P43694 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA4P43694 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA4P43694 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA4P43694 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA4P43694 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA4P43694 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA4P43694 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA4P43694 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA4P43694 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA4P43694 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA4P43694 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA4P43694 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA4P43694 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA4P43694 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA4P43694 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA4P43694 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA4P43694 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA4P43694 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA4P43694 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA4P43694 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA4P43694 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA4P43694 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA4P43694 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA4P43694 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA4P43694 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA4P43694 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA4P43694 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA4P43694 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA4P43694 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA4P43694 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA4P43694 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA4P43694 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA4P43694 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA4P43694 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA4P43694 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA4P43694 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA4P43694 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA4P43694 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA4P43694 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA4P43694 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA4P43694 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA4P43694 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA4P43694 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA4P43694 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA4P43694 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA4P43694 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA4P43694 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA4P43694 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA4P43694 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA4P43694 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA4P43694 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA4P43694 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA4P43694 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA4P43694 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA4P43694 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA4P43694 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA4P43694 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA4P43694 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA4P43694 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA4P43694 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA4P43694 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA4P43694 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA4P43694 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA4P43694 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA4P43694 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GATA4P43694 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GATA4P43694 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms