Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms