Protein–RNA interactions for Protein: P40306

PSMB10, Proteasome subunit beta type-10, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB10P40306 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB10P40306 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms