Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP62P37198 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP62P37198 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP62P37198 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP62P37198 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP62P37198 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP62P37198 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP62P37198 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP62P37198 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP62P37198 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP62P37198 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP62P37198 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP62P37198 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP62P37198 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP62P37198 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP62P37198 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP62P37198 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP62P37198 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP62P37198 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP62P37198 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP62P37198 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP62P37198 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP62P37198 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP62P37198 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP62P37198 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP62P37198 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP62P37198 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP62P37198 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP62P37198 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP62P37198 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP62P37198 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP62P37198 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP62P37198 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP62P37198 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP62P37198 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP62P37198 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP62P37198 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP62P37198 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP62P37198 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP62P37198 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP62P37198 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP62P37198 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP62P37198 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP62P37198 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP62P37198 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP62P37198 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP62P37198 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP62P37198 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP62P37198 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP62P37198 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP62P37198 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP62P37198 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP62P37198 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP62P37198 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP62P37198 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP62P37198 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP62P37198 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP62P37198 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP62P37198 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP62P37198 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP62P37198 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP62P37198 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP62P37198 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP62P37198 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP62P37198 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP62P37198 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP62P37198 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP62P37198 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP62P37198 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP62P37198 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP62P37198 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP62P37198 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP62P37198 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP62P37198 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP62P37198 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP62P37198 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP62P37198 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP62P37198 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP62P37198 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP62P37198 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP62P37198 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP62P37198 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP62P37198 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP62P37198 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP62P37198 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP62P37198 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP62P37198 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP62P37198 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP62P37198 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP62P37198 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP62P37198 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP62P37198 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP62P37198 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP62P37198 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP62P37198 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP62P37198 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP62P37198 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP62P37198 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP62P37198 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP62P37198 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms