Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB2P35606 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB2P35606 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB2P35606 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB2P35606 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB2P35606 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB2P35606 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB2P35606 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB2P35606 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB2P35606 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB2P35606 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB2P35606 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB2P35606 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB2P35606 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB2P35606 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB2P35606 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB2P35606 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB2P35606 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB2P35606 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB2P35606 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB2P35606 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB2P35606 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB2P35606 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB2P35606 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB2P35606 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB2P35606 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB2P35606 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB2P35606 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB2P35606 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB2P35606 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB2P35606 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB2P35606 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB2P35606 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB2P35606 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB2P35606 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB2P35606 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB2P35606 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB2P35606 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB2P35606 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB2P35606 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB2P35606 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB2P35606 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB2P35606 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB2P35606 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB2P35606 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB2P35606 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB2P35606 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB2P35606 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB2P35606 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB2P35606 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB2P35606 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB2P35606 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB2P35606 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB2P35606 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB2P35606 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB2P35606 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB2P35606 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB2P35606 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB2P35606 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB2P35606 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB2P35606 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB2P35606 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB2P35606 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB2P35606 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB2P35606 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB2P35606 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB2P35606 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB2P35606 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB2P35606 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB2P35606 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB2P35606 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB2P35606 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB2P35606 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB2P35606 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB2P35606 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB2P35606 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB2P35606 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB2P35606 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB2P35606 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB2P35606 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB2P35606 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB2P35606 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB2P35606 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB2P35606 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB2P35606 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB2P35606 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB2P35606 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB2P35606 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB2P35606 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB2P35606 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB2P35606 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB2P35606 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB2P35606 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB2P35606 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB2P35606 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB2P35606 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB2P35606 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB2P35606 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPB2P35606 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPB2P35606 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms