Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX2P32243 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX2P32243 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX2P32243 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX2P32243 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX2P32243 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX2P32243 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX2P32243 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX2P32243 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX2P32243 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX2P32243 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX2P32243 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX2P32243 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX2P32243 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX2P32243 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX2P32243 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX2P32243 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX2P32243 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX2P32243 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX2P32243 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX2P32243 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX2P32243 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX2P32243 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OTX2P32243 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OTX2P32243 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OTX2P32243 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OTX2P32243 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OTX2P32243 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OTX2P32243 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
OTX2P32243 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
OTX2P32243 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
OTX2P32243 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OTX2P32243 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX2P32243 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX2P32243 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX2P32243 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX2P32243 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX2P32243 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX2P32243 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX2P32243 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX2P32243 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX2P32243 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX2P32243 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX2P32243 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX2P32243 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX2P32243 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX2P32243 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX2P32243 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX2P32243 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX2P32243 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX2P32243 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX2P32243 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX2P32243 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX2P32243 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX2P32243 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX2P32243 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX2P32243 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX2P32243 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX2P32243 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX2P32243 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX2P32243 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX2P32243 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX2P32243 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX2P32243 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX2P32243 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX2P32243 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX2P32243 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX2P32243 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX2P32243 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX2P32243 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX2P32243 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX2P32243 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX2P32243 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX2P32243 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX2P32243 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX2P32243 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX2P32243 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX2P32243 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX2P32243 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX2P32243 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX2P32243 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX2P32243 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX2P32243 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX2P32243 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX2P32243 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX2P32243 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX2P32243 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX2P32243 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX2P32243 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX2P32243 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX2P32243 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX2P32243 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms