Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPS1P31327 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CPS1P31327 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPS1P31327 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPS1P31327 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPS1P31327 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPS1P31327 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPS1P31327 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPS1P31327 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CPS1P31327 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPS1P31327 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPS1P31327 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CPS1P31327 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPS1P31327 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPS1P31327 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPS1P31327 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPS1P31327 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPS1P31327 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPS1P31327 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPS1P31327 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPS1P31327 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPS1P31327 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CPS1P31327 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPS1P31327 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPS1P31327 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPS1P31327 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPS1P31327 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPS1P31327 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPS1P31327 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CPS1P31327 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPS1P31327 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPS1P31327 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPS1P31327 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPS1P31327 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPS1P31327 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CPS1P31327 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPS1P31327 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPS1P31327 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPS1P31327 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPS1P31327 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPS1P31327 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPS1P31327 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPS1P31327 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPS1P31327 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPS1P31327 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPS1P31327 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPS1P31327 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CPS1P31327 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPS1P31327 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPS1P31327 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPS1P31327 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPS1P31327 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPS1P31327 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPS1P31327 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPS1P31327 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPS1P31327 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPS1P31327 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPS1P31327 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPS1P31327 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPS1P31327 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPS1P31327 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CPS1P31327 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPS1P31327 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPS1P31327 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPS1P31327 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CPS1P31327 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CPS1P31327 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CPS1P31327 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CPS1P31327 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CPS1P31327 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CPS1P31327 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CPS1P31327 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CPS1P31327 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CPS1P31327 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CPS1P31327 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CPS1P31327 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CPS1P31327 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CPS1P31327 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CPS1P31327 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CPS1P31327 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CPS1P31327 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPS1P31327 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPS1P31327 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CPS1P31327 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPS1P31327 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPS1P31327 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPS1P31327 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPS1P31327 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CPS1P31327 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPS1P31327 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPS1P31327 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPS1P31327 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPS1P31327 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPS1P31327 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPS1P31327 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPS1P31327 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPS1P31327 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPS1P31327 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPS1P31327 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPS1P31327 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms