Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms