Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC27P30260 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC27P30260 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC27P30260 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC27P30260 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC27P30260 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC27P30260 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC27P30260 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC27P30260 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC27P30260 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC27P30260 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC27P30260 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC27P30260 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC27P30260 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC27P30260 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC27P30260 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC27P30260 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC27P30260 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC27P30260 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC27P30260 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC27P30260 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC27P30260 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC27P30260 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC27P30260 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC27P30260 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC27P30260 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC27P30260 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC27P30260 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC27P30260 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC27P30260 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC27P30260 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC27P30260 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC27P30260 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC27P30260 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC27P30260 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC27P30260 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC27P30260 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC27P30260 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC27P30260 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC27P30260 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC27P30260 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC27P30260 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC27P30260 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC27P30260 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC27P30260 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC27P30260 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC27P30260 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC27P30260 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC27P30260 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC27P30260 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC27P30260 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC27P30260 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC27P30260 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC27P30260 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC27P30260 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC27P30260 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC27P30260 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC27P30260 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC27P30260 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC27P30260 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC27P30260 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC27P30260 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC27P30260 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC27P30260 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC27P30260 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC27P30260 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC27P30260 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDC27P30260 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDC27P30260 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDC27P30260 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDC27P30260 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDC27P30260 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDC27P30260 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDC27P30260 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDC27P30260 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC27P30260 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC27P30260 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC27P30260 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC27P30260 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC27P30260 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC27P30260 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC27P30260 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC27P30260 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC27P30260 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC27P30260 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC27P30260 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC27P30260 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC27P30260 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC27P30260 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC27P30260 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC27P30260 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC27P30260 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC27P30260 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC27P30260 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC27P30260 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC27P30260 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC27P30260 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC27P30260 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC27P30260 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC27P30260 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms