Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms