Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms