Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms