Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTSSP25774 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTSSP25774 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTSSP25774 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTSSP25774 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTSSP25774 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTSSP25774 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTSSP25774 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTSSP25774 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTSSP25774 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CTSSP25774 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTSSP25774 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTSSP25774 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTSSP25774 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTSSP25774 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CTSSP25774 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CTSSP25774 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTSSP25774 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTSSP25774 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTSSP25774 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTSSP25774 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTSSP25774 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTSSP25774 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTSSP25774 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTSSP25774 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTSSP25774 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTSSP25774 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTSSP25774 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTSSP25774 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTSSP25774 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTSSP25774 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTSSP25774 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTSSP25774 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTSSP25774 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTSSP25774 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTSSP25774 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTSSP25774 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTSSP25774 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTSSP25774 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTSSP25774 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTSSP25774 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTSSP25774 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTSSP25774 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTSSP25774 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTSSP25774 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTSSP25774 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTSSP25774 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTSSP25774 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTSSP25774 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTSSP25774 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTSSP25774 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTSSP25774 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTSSP25774 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTSSP25774 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTSSP25774 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTSSP25774 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTSSP25774 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTSSP25774 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTSSP25774 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTSSP25774 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTSSP25774 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTSSP25774 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTSSP25774 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTSSP25774 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTSSP25774 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTSSP25774 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTSSP25774 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CTSSP25774 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTSSP25774 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTSSP25774 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTSSP25774 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTSSP25774 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTSSP25774 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTSSP25774 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTSSP25774 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTSSP25774 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTSSP25774 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTSSP25774 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTSSP25774 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTSSP25774 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTSSP25774 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTSSP25774 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTSSP25774 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CTSSP25774 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTSSP25774 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CTSSP25774 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTSSP25774 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTSSP25774 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTSSP25774 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTSSP25774 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTSSP25774 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTSSP25774 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTSSP25774 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTSSP25774 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTSSP25774 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTSSP25774 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTSSP25774 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTSSP25774 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTSSP25774 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTSSP25774 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms