Protein–RNA interactions for Protein: P21741

MDK, Midkine, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDKP21741 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MDKP21741 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MDKP21741 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDKP21741 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MDKP21741 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDKP21741 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDKP21741 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDKP21741 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDKP21741 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDKP21741 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDKP21741 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDKP21741 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDKP21741 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDKP21741 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDKP21741 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDKP21741 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDKP21741 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDKP21741 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDKP21741 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDKP21741 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDKP21741 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDKP21741 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDKP21741 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDKP21741 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDKP21741 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDKP21741 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDKP21741 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDKP21741 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MDKP21741 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MDKP21741 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDKP21741 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDKP21741 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDKP21741 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDKP21741 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDKP21741 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDKP21741 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDKP21741 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDKP21741 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDKP21741 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDKP21741 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDKP21741 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDKP21741 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDKP21741 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDKP21741 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDKP21741 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDKP21741 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDKP21741 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDKP21741 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDKP21741 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDKP21741 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDKP21741 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDKP21741 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDKP21741 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDKP21741 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDKP21741 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDKP21741 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDKP21741 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDKP21741 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDKP21741 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MDKP21741 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MDKP21741 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDKP21741 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms