Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TRHP20396 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRHP20396 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TRHP20396 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRHP20396 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRHP20396 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRHP20396 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRHP20396 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRHP20396 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRHP20396 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRHP20396 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TRHP20396 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRHP20396 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TRHP20396 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRHP20396 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TRHP20396 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TRHP20396 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRHP20396 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRHP20396 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRHP20396 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRHP20396 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRHP20396 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRHP20396 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRHP20396 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRHP20396 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRHP20396 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRHP20396 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRHP20396 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TRHP20396 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRHP20396 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRHP20396 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRHP20396 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRHP20396 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TRHP20396 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRHP20396 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRHP20396 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRHP20396 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRHP20396 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TRHP20396 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TRHP20396 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TRHP20396 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRHP20396 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRHP20396 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRHP20396 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRHP20396 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRHP20396 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRHP20396 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRHP20396 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRHP20396 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRHP20396 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRHP20396 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRHP20396 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRHP20396 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRHP20396 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRHP20396 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRHP20396 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRHP20396 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRHP20396 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRHP20396 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRHP20396 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRHP20396 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRHP20396 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRHP20396 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRHP20396 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRHP20396 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRHP20396 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRHP20396 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRHP20396 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRHP20396 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TRHP20396 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRHP20396 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TRHP20396 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRHP20396 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TRHP20396 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRHP20396 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRHP20396 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRHP20396 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRHP20396 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRHP20396 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRHP20396 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRHP20396 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRHP20396 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRHP20396 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRHP20396 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRHP20396 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRHP20396 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRHP20396 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRHP20396 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRHP20396 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRHP20396 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRHP20396 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRHP20396 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRHP20396 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TRHP20396 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TRHP20396 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRHP20396 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRHP20396 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRHP20396 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRHP20396 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TRHP20396 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
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