Protein–RNA interactions for Protein: P19419

ELK1, ETS domain-containing protein Elk-1, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK1P19419 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELK1P19419 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELK1P19419 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELK1P19419 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELK1P19419 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELK1P19419 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ELK1P19419 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELK1P19419 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELK1P19419 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELK1P19419 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELK1P19419 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELK1P19419 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELK1P19419 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELK1P19419 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELK1P19419 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELK1P19419 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELK1P19419 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ELK1P19419 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELK1P19419 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELK1P19419 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELK1P19419 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELK1P19419 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ELK1P19419 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELK1P19419 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELK1P19419 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELK1P19419 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ELK1P19419 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELK1P19419 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELK1P19419 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELK1P19419 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELK1P19419 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELK1P19419 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELK1P19419 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELK1P19419 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELK1P19419 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELK1P19419 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELK1P19419 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELK1P19419 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELK1P19419 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELK1P19419 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELK1P19419 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELK1P19419 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELK1P19419 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELK1P19419 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELK1P19419 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELK1P19419 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELK1P19419 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELK1P19419 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELK1P19419 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ELK1P19419 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ELK1P19419 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELK1P19419 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELK1P19419 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ELK1P19419 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELK1P19419 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELK1P19419 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELK1P19419 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELK1P19419 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELK1P19419 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELK1P19419 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELK1P19419 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELK1P19419 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELK1P19419 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELK1P19419 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELK1P19419 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELK1P19419 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELK1P19419 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELK1P19419 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELK1P19419 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELK1P19419 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELK1P19419 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELK1P19419 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELK1P19419 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELK1P19419 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELK1P19419 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELK1P19419 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELK1P19419 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELK1P19419 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELK1P19419 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELK1P19419 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELK1P19419 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELK1P19419 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELK1P19419 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELK1P19419 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELK1P19419 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELK1P19419 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELK1P19419 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELK1P19419 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELK1P19419 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELK1P19419 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELK1P19419 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELK1P19419 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELK1P19419 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELK1P19419 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELK1P19419 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ELK1P19419 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELK1P19419 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ELK1P19419 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELK1P19419 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELK1P19419 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms