Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME1P15531 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME1P15531 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NME1P15531 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME1P15531 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME1P15531 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME1P15531 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME1P15531 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME1P15531 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME1P15531 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME1P15531 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME1P15531 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME1P15531 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME1P15531 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME1P15531 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME1P15531 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME1P15531 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME1P15531 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME1P15531 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NME1P15531 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NME1P15531 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME1P15531 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME1P15531 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NME1P15531 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NME1P15531 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NME1P15531 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NME1P15531 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NME1P15531 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NME1P15531 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
NME1P15531 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NME1P15531 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NME1P15531 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NME1P15531 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NME1P15531 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NME1P15531 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NME1P15531 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME1P15531 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NME1P15531 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME1P15531 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME1P15531 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME1P15531 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME1P15531 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME1P15531 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME1P15531 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME1P15531 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME1P15531 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NME1P15531 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME1P15531 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME1P15531 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME1P15531 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME1P15531 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME1P15531 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME1P15531 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME1P15531 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME1P15531 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME1P15531 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME1P15531 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME1P15531 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME1P15531 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME1P15531 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME1P15531 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME1P15531 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME1P15531 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME1P15531 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME1P15531 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME1P15531 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME1P15531 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NME1P15531 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NME1P15531 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NME1P15531 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME1P15531 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NME1P15531 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME1P15531 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME1P15531 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME1P15531 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME1P15531 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME1P15531 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME1P15531 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME1P15531 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME1P15531 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME1P15531 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME1P15531 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME1P15531 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME1P15531 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME1P15531 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME1P15531 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME1P15531 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME1P15531 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME1P15531 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME1P15531 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME1P15531 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME1P15531 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME1P15531 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NME1P15531 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NME1P15531 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME1P15531 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME1P15531 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME1P15531 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME1P15531 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME1P15531 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms