Protein–RNA interactions for Protein: P10606

COX5B, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5BP10606 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX5BP10606 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX5BP10606 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX5BP10606 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX5BP10606 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX5BP10606 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX5BP10606 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX5BP10606 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX5BP10606 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
COX5BP10606 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX5BP10606 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX5BP10606 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX5BP10606 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX5BP10606 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX5BP10606 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX5BP10606 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX5BP10606 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX5BP10606 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX5BP10606 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX5BP10606 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX5BP10606 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX5BP10606 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX5BP10606 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX5BP10606 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX5BP10606 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX5BP10606 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX5BP10606 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX5BP10606 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
COX5BP10606 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX5BP10606 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX5BP10606 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX5BP10606 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX5BP10606 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX5BP10606 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX5BP10606 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX5BP10606 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX5BP10606 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COX5BP10606 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX5BP10606 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX5BP10606 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX5BP10606 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX5BP10606 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX5BP10606 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX5BP10606 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX5BP10606 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX5BP10606 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COX5BP10606 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX5BP10606 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX5BP10606 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX5BP10606 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COX5BP10606 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX5BP10606 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX5BP10606 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX5BP10606 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX5BP10606 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX5BP10606 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms