Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00032P0C843 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms