Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms