Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFMP07197 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFMP07197 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFMP07197 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFMP07197 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFMP07197 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFMP07197 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFMP07197 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFMP07197 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFMP07197 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFMP07197 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFMP07197 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFMP07197 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFMP07197 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFMP07197 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFMP07197 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFMP07197 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFMP07197 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFMP07197 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFMP07197 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFMP07197 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFMP07197 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFMP07197 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFMP07197 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFMP07197 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFMP07197 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFMP07197 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFMP07197 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFMP07197 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFMP07197 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFMP07197 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFMP07197 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFMP07197 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFMP07197 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFMP07197 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFMP07197 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFMP07197 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFMP07197 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFMP07197 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFMP07197 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFMP07197 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFMP07197 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFMP07197 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFMP07197 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFMP07197 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFMP07197 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFMP07197 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFMP07197 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFMP07197 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFMP07197 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFMP07197 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NEFMP07197 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NEFMP07197 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NEFMP07197 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NEFMP07197 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NEFMP07197 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFMP07197 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFMP07197 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFMP07197 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFMP07197 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFMP07197 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFMP07197 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFMP07197 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFMP07197 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFMP07197 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFMP07197 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFMP07197 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFMP07197 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFMP07197 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFMP07197 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFMP07197 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFMP07197 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFMP07197 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFMP07197 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFMP07197 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFMP07197 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFMP07197 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFMP07197 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFMP07197 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFMP07197 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFMP07197 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEFMP07197 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEFMP07197 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEFMP07197 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEFMP07197 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEFMP07197 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEFMP07197 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEFMP07197 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEFMP07197 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEFMP07197 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEFMP07197 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NEFMP07197 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEFMP07197 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEFMP07197 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEFMP07197 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEFMP07197 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEFMP07197 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEFMP07197 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEFMP07197 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFMP07197 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms