Protein–RNA interactions for Protein: P01624

IGKV3-15, Immunoglobulin kappa variable 3-15, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-15P01624 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV3-15P01624 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms