Protein–RNA interactions for Protein: O96008

TOMM40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40O96008 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TOMM40O96008 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms