Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POP4O95707 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POP4O95707 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POP4O95707 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POP4O95707 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POP4O95707 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POP4O95707 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POP4O95707 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POP4O95707 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POP4O95707 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POP4O95707 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POP4O95707 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POP4O95707 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POP4O95707 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POP4O95707 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POP4O95707 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POP4O95707 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POP4O95707 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
POP4O95707 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POP4O95707 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POP4O95707 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POP4O95707 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POP4O95707 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POP4O95707 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POP4O95707 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POP4O95707 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POP4O95707 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POP4O95707 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
POP4O95707 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POP4O95707 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POP4O95707 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POP4O95707 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POP4O95707 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POP4O95707 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POP4O95707 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POP4O95707 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POP4O95707 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POP4O95707 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POP4O95707 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POP4O95707 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POP4O95707 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POP4O95707 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POP4O95707 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POP4O95707 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POP4O95707 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
POP4O95707 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POP4O95707 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POP4O95707 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POP4O95707 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POP4O95707 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POP4O95707 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POP4O95707 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POP4O95707 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POP4O95707 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POP4O95707 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POP4O95707 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POP4O95707 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POP4O95707 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POP4O95707 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POP4O95707 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POP4O95707 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POP4O95707 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms